○ 1999.04.15. (사)돼지콜레라박멸비상대책본부 설립

○ 2000.06.21. (사)가축위생방역지원본부 인가
○ 2003.06.27. (특)가축위생방역지원본부 설립(가축전염병예방법 제9조 제2항)

○ 2005.06.12. 포유류도축장 검사지원업무 수임

○ 2007.04.11. 농식품부 산하 기타공공기관으로 지정

○ 2007.10.11. 공공기관 혁신평가 우수기관 선정(기획예산처장관 표창 수상)

○ 2009.03.12. 수입식용축산물 검역검사업무 수임

○ 2010.~2014. 공공기관 고객만족도 5년 연속 우수기관 선정

○ 2011.03.10. 질병예찰 및 신고ㆍ상담 콜센터 사업 수임

○ 2014.07.01. 가금류도축장 검사지원업무 수임

○ 2015.06.22. 가축사육시설 관련 정보의 수집ㆍ제공 사업 수임
○ 2015.09.18. 본부 이전 (경기도 안양시 ⇒ 세종특별자치시)
○ 2015.12.15. 일자리 창출 유공 포상(고용노동부장관 표창 수상)
○ 2016.~2017. 기타공공기관 경영평가 2년 연속 우수기관 선정
○ 2017.12.08. 가족친화 우수기관 인증(여성가족부 주관)
○ 2019.03.29. 공공기관 고객만족도 우수기관 선정

① 가축의 예방접종, 약물목욕, 임상검사 및 검사시료 채취
- 관련 법령 : 가축전염병예방법 제9조

② 축산물의 위생검사
- 관련 법령 : 축산물위생관리법 제44조

③ 검역시행장의 수입식용축산물 현물검사
- 관련 법령 : 가축전염병예방법 제42조
④ 가축전염병 예방을 위한 소독 및 교육ㆍ홍보
- 관련 법령 : 가축전염병예방법 제9조

⑤ 국가가축방역통합정보시스템의 운영에 필요한 가축사육시설 관련 정보의 수집ㆍ제공('15)
- 관련 법령 : 가축전염병예방법 제9조
⑥ 가축전염병 예방을 위한 축산농가 상담ㆍ예찰 업무
⑦ 가축방역사ㆍ검사원의 교육 및 양성
- 관련 법령 : 가축전염병예방법 제8조, 축산물위생관리법 제14조
⑧ 국가와 지방자치단체로부터 위탁받은 사업 및 그 부대사업
- 관련 법령 : 가축전염병예방법 제9조